288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4055 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 		 205 aa  406  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  60.22 
 
 		 193 aa  228  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.07 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.1 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  51.17 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  55 
 
 		 191 aa  205  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.95 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  60.12 
 
 		 279 aa  204  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  56.65 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  55.25 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.89 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  56.57 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  55.06 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  56.9 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  55.25 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  55.25 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  56.57 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  52.94 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  52.78 
 
 		 282 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  54.49 
 
 		 251 aa  191  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.3 
 
 		 320 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  55.62 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  52.15 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.76 
 
 		 224 aa  178  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  58.39 
 
 		 229 aa  178  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  53.76 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  54.12 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  58.62 
 
 		 191 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.28 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  58.82 
 
 		 238 aa  174  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.94 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.29 
 
 		 208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  43.58 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.52 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.29 
 
 		 254 aa  158  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.51 
 
 		 269 aa  146  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.62 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  46.63 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  40.59 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 		 284 aa  124  9e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.68 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.64 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  39.33 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  39.02 
 
 		 299 aa  108  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  34.36 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.18 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.14 
 
 		 273 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.42 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  39.29 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  39.78 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  38.42 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  38.61 
 
 		 372 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  33.92 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.61 
 
 		 387 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  38.61 
 
 		 387 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.18 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  44.2 
 
 		 353 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.85 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 		 352 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  39.39 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.76 
 
 		 237 aa  101  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.18 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  31.07 
 
 		 195 aa  101  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  38.04 
 
 		 274 aa  101  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  31.64 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.24 
 
 		 534 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.81 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  42.46 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  38.51 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  33.52 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.77 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.13 
 
 		 176 aa  99  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  36.81 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  38.37 
 
 		 330 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  35.62 
 
 		 171 aa  98.6  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  36.53 
 
 		 171 aa  98.2  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  35.88 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  37.79 
 
 		 332 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  37.95 
 
 		 178 aa  95.9  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  34.39 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1551  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 180 aa  95.5  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1582  segregation and condensation protein B  30.25 
 
 		 180 aa  95.5  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.39 
 
 		 228 aa  95.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  28.73 
 
 		 237 aa  95.1  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 168 aa  95.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 		 190 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  42.65 
 
 		 194 aa  94.7  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.41 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  39.64 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.77 
 
 		 447 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>