292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1205 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  83.71 
 
 		 224 aa  295  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  70.86 
 
 		 252 aa  246  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  66.13 
 
 		 185 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  69.82 
 
 		 196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  62.3 
 
 		 241 aa  219  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  62.07 
 
 		 191 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  66.67 
 
 		 253 aa  212  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  59.67 
 
 		 282 aa  211  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  59.78 
 
 		 320 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  63.31 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  60.95 
 
 		 261 aa  204  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  62.29 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  54.4 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.71 
 
 		 224 aa  197  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  56.5 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.33 
 
 		 279 aa  192  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  57.95 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  62.09 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.47 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  55.14 
 
 		 231 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  55.81 
 
 		 205 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  54.01 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.97 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  53.48 
 
 		 231 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  53.48 
 
 		 231 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.25 
 
 		 254 aa  185  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  55.19 
 
 		 243 aa  181  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  59.48 
 
 		 238 aa  178  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  59.88 
 
 		 229 aa  177  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  52.46 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.12 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  52.11 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  59.24 
 
 		 237 aa  165  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.41 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.34 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.97 
 
 		 269 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  44.51 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  45.68 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 284 aa  121  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.12 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.99 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  40.61 
 
 		 387 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.61 
 
 		 387 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.25 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  40.61 
 
 		 372 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.11 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 352 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  42.59 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  41.62 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.24 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  41.21 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  42.76 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  43.45 
 
 		 353 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  42.04 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  36.21 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 		 282 aa  105  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.61 
 
 		 534 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.17 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.49 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  35.62 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  42.17 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  37.28 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  38.1 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  37.28 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  37.5 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  33.73 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  39.51 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  43.75 
 
 		 302 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  38.32 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.1 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.12 
 
 		 281 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  40.65 
 
 		 274 aa  101  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  36.88 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  28.74 
 
 		 237 aa  101  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.65 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  36.69 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  36.69 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  36.69 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  36.69 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  40.85 
 
 		 261 aa  101  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  36.48 
 
 		 190 aa  101  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  40.83 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  36.69 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  42.5 
 
 		 311 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  35.47 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  39.02 
 
 		 343 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  39.02 
 
 		 345 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  39.02 
 
 		 345 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  39.02 
 
 		 340 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  39.02 
 
 		 340 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  39.02 
 
 		 345 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.82 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  39.02 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  36.36 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 442 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 442 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 442 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>