283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2874 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  78.84 
 
 		 261 aa  300  8.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  68.25 
 
 		 281 aa  278  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  72.45 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  76.33 
 
 		 244 aa  271  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  69.54 
 
 		 230 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0086  putative transcriptional regulator  77.98 
 
 		 216 aa  269  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  71.27 
 
 		 394 aa  266  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  72.35 
 
 		 304 aa  264  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  71.27 
 
 		 408 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  71.18 
 
 		 280 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  70.05 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  75.6 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  71.75 
 
 		 360 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  72.02 
 
 		 456 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  72.02 
 
 		 456 aa  260  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  72.02 
 
 		 458 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  72.02 
 
 		 455 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  62.86 
 
 		 343 aa  259  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.72 
 
 		 389 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  71.43 
 
 		 345 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  71.43 
 
 		 345 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  71.43 
 
 		 345 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  71.43 
 
 		 340 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  71.43 
 
 		 442 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  71.43 
 
 		 442 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  71.43 
 
 		 442 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  70.83 
 
 		 349 aa  256  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  71.43 
 
 		 442 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  71.43 
 
 		 340 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  67.72 
 
 		 311 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  70.24 
 
 		 302 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  71.01 
 
 		 221 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5025  segregation and condensation protein B  76.79 
 
 		 278 aa  252  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2319  putative transcriptional regulator  66.88 
 
 		 211 aa  222  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.62874  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  61.4 
 
 		 246 aa  221  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  60.82 
 
 		 254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  59.88 
 
 		 178 aa  214  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  64.2 
 
 		 200 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  58.08 
 
 		 221 aa  201  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  57.32 
 
 		 184 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  46.01 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  43.4 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  52.66 
 
 		 236 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  42.92 
 
 		 209 aa  171  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  47.93 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  56.52 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  47.9 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  47.9 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  47.9 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  47.9 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.9 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  46.75 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  46.2 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  47.98 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  46.75 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  46.75 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  46.75 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  44.85 
 
 		 352 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  49.74 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  44.19 
 
 		 198 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 226 aa  157  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  48.15 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  48.15 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  46.63 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  49.38 
 
 		 399 aa  155  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  50 
 
 		 291 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  43.92 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  48.47 
 
 		 263 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  44.13 
 
 		 287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  43.71 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  53.64 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  44.85 
 
 		 250 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  47.93 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  48.86 
 
 		 330 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  48.86 
 
 		 332 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  44.58 
 
 		 259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  44.58 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  43.6 
 
 		 256 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  44.58 
 
 		 277 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  39.52 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  37.1 
 
 		 193 aa  141  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  45.96 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  45.96 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  45.4 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  44.72 
 
 		 337 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1955  putative transcriptional regulator  59.05 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1016  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  40.36 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1468  segregation and condensation protein B  44.03 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1791  segregation and condensation protein B  44.03 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.34 
 
 		 387 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  45.34 
 
 		 372 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  44.17 
 
 		 387 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  40.36 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.87 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  44.38 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  36.69 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  42.42 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>