281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2035 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 302 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  70.63 
 
 		 311 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  84.9 
 
 		 280 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  85.56 
 
 		 304 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  84.9 
 
 		 389 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  66.8 
 
 		 394 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  70.43 
 
 		 408 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  75.12 
 
 		 343 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  81.72 
 
 		 349 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  80.65 
 
 		 456 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  80.65 
 
 		 456 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  78.65 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  67.77 
 
 		 340 aa  319  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  80.65 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  80.65 
 
 		 458 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  80.21 
 
 		 345 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  80.21 
 
 		 345 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  80.21 
 
 		 345 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  79.79 
 
 		 340 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  79.57 
 
 		 442 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  79.57 
 
 		 442 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  79.57 
 
 		 442 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  79.57 
 
 		 442 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.49 
 
 		 234 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  57.32 
 
 		 234 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  71.51 
 
 		 261 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  71.26 
 
 		 274 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.29 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  63.98 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  68.97 
 
 		 206 aa  255  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0086  putative transcriptional regulator  70.41 
 
 		 216 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  63.54 
 
 		 244 aa  248  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  62.05 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  65.9 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  62.05 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5025  segregation and condensation protein B  62.63 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  64.29 
 
 		 178 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2319  putative transcriptional regulator  66.03 
 
 		 211 aa  224  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.62874  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  61.9 
 
 		 221 aa  222  7e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  64.24 
 
 		 200 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  58.72 
 
 		 184 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  53.49 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  52.91 
 
 		 209 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  46.57 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  49.43 
 
 		 198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  47.52 
 
 		 206 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  51.72 
 
 		 198 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  51.72 
 
 		 198 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  51.72 
 
 		 198 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  51.72 
 
 		 198 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  50.58 
 
 		 245 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  50.57 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  50.57 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.57 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  50.57 
 
 		 198 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  50.57 
 
 		 198 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  52.17 
 
 		 399 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  52.63 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  50.3 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  49.7 
 
 		 197 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  50.3 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  51.55 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  48.3 
 
 		 214 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  48.86 
 
 		 226 aa  175  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  50.3 
 
 		 291 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  46.38 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  54.6 
 
 		 194 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  52.76 
 
 		 201 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  48.82 
 
 		 198 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  51.61 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  44.91 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  54.93 
 
 		 210 aa  162  9e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  49.09 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  49.09 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  45.41 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  45.41 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.34 
 
 		 228 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  49.4 
 
 		 332 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  49.4 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  39.73 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  41.71 
 
 		 259 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  54.2 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  42.94 
 
 		 193 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  45.18 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  42.94 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  43.24 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  43.68 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  35.87 
 
 		 195 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  37.99 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1016  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.35 
 
 		 194 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.65 
 
 		 534 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1468  segregation and condensation protein B  40.8 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1791  segregation and condensation protein B  40.8 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1955  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  45.71 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 		 352 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  39.38 
 
 		 183 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.42 
 
 		 192 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 186 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 		 206 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>