277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1533 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  78.7 
 
 		 221 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.55 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.19 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  53.21 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.66 
 
 		 252 aa  208  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  54.4 
 
 		 193 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.11 
 
 		 254 aa  197  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  52.85 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  46.64 
 
 		 282 aa  194  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  51.24 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.5 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  51.53 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.21 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  60.27 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  46.88 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  53.12 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  52.13 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  47.26 
 
 		 191 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.15 
 
 		 205 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  45.13 
 
 		 252 aa  174  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.75 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.19 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.65 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  43.5 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  43.81 
 
 		 241 aa  168  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  44.04 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  50.26 
 
 		 191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  44.04 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  44.04 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  43.11 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.52 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  47.69 
 
 		 238 aa  157  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  47.83 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.49 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.1 
 
 		 225 aa  128  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.51 
 
 		 269 aa  125  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  35.27 
 
 		 243 aa  118  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  38.04 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  34.22 
 
 		 284 aa  106  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.43 
 
 		 197 aa  105  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  43.8 
 
 		 353 aa  101  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  35.36 
 
 		 387 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  34.81 
 
 		 372 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.81 
 
 		 387 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  36.17 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 181 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.26 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  33.51 
 
 		 171 aa  95.9  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 352 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  32.45 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  29.87 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.64 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  37.08 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  38.94 
 
 		 198 aa  92.8  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  34.73 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  34.13 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.5 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.41 
 
 		 281 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.35 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  37.58 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 184 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.2 
 
 		 189 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  33.53 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  33.53 
 
 		 277 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  38.6 
 
 		 171 aa  88.6  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  33.16 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.59 
 
 		 196 aa  88.2  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  31.84 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  39.82 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  32.24 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  33.67 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  34.01 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 		 179 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  35.33 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.67 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  35.93 
 
 		 330 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  40.52 
 
 		 193 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  34.04 
 
 		 261 aa  85.9  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  32.65 
 
 		 299 aa  86.3  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.69 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.82 
 
 		 196 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.73 
 
 		 192 aa  85.9  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  31.82 
 
 		 202 aa  85.9  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  34.13 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  31.37 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  34.12 
 
 		 257 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  32.93 
 
 		 337 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  35.98 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  40.52 
 
 		 193 aa  85.1  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.74 
 
 		 273 aa  85.1  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  34.73 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  31.25 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.3 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  32.97 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  37.07 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>