288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0392 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
273 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  77.78 
 
 
196 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  62.03 
 
 
190 aa  228  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  61.5 
 
 
190 aa  228  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  61.96 
 
 
190 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  61.96 
 
 
190 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  61.96 
 
 
190 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  61.96 
 
 
190 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  61.96 
 
 
190 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  61.96 
 
 
190 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  61.41 
 
 
190 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  63.1 
 
 
190 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  60.43 
 
 
190 aa  217  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.11 
 
 
187 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  52 
 
 
195 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  50.62 
 
 
183 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  47.24 
 
 
199 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  48.26 
 
 
181 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.66 
 
 
189 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.4 
 
 
196 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  43.72 
 
 
201 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  48.5 
 
 
179 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  41.81 
 
 
196 aa  143  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.62 
 
 
192 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf011  segregation and condensation protein B  39.06 
 
 
206 aa  142  7e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  43.43 
 
 
195 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  43.43 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  45.83 
 
 
192 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  47.9 
 
 
171 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 
168 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  42.39 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 
188 aa  132  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  39.66 
 
 
189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  42.42 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  40.32 
 
 
193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  42.11 
 
 
199 aa  129  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  44.38 
 
 
194 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.77 
 
 
225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.25 
 
 
190 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.05 
 
 
193 aa  125  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.75 
 
 
534 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0353  segregation and condensation protein B  37.37 
 
 
388 aa  125  7e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.260202  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  42.26 
 
 
284 aa  125  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  44.24 
 
 
195 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  38.59 
 
 
180 aa  123  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  47.44 
 
 
274 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  46.15 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.18 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.05 
 
 
198 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  44.05 
 
 
198 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  44.05 
 
 
198 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1551  putative transcriptional regulator  38.12 
 
 
180 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  44.97 
 
 
226 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  44.05 
 
 
198 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  46.15 
 
 
198 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  46.15 
 
 
198 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  44.05 
 
 
198 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1582  segregation and condensation protein B  38.12 
 
 
180 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  46.15 
 
 
198 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  44.83 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  45.05 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.01 
 
 
176 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  42.94 
 
 
222 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  41.62 
 
 
193 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  41.62 
 
 
193 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 
189 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  46.9 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  42.44 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  41.07 
 
 
205 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  43.79 
 
 
210 aa  116  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  44.05 
 
 
214 aa  115  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  42.6 
 
 
206 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  41.86 
 
 
209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  46.1 
 
 
184 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  44.19 
 
 
245 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  40.72 
 
 
243 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  40.82 
 
 
197 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.12 
 
 
165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  43.98 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  41.1 
 
 
201 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  41.36 
 
 
206 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.05 
 
 
387 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.38 
 
 
179 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  42.05 
 
 
372 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  40.94 
 
 
191 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  41.44 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  41.4 
 
 
194 aa  112  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  43.02 
 
 
195 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  37 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  40.23 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  38.29 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  34.69 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  34.69 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  43.83 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  34.69 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.25 
 
 
211 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  41.27 
 
 
352 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  35.03 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  39.18 
 
 
171 aa  108  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>