279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2154 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
220 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  66.51 
 
 
224 aa  259  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  67.21 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  67.65 
 
 
252 aa  222  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  54.55 
 
 
229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  63.89 
 
 
224 aa  217  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.25 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  58.67 
 
 
191 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  60.57 
 
 
241 aa  205  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.95 
 
 
205 aa  204  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.4 
 
 
261 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  61.24 
 
 
205 aa  202  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  62.29 
 
 
193 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  62.43 
 
 
196 aa  201  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  62.71 
 
 
185 aa  201  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  59.89 
 
 
282 aa  201  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.37 
 
 
193 aa  201  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  62.36 
 
 
251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  56.82 
 
 
252 aa  198  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.33 
 
 
320 aa  198  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  56.57 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  63.69 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  56.57 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  55.49 
 
 
238 aa  194  6e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  56 
 
 
231 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  50.23 
 
 
243 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  60.57 
 
 
224 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  64.41 
 
 
191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  56 
 
 
231 aa  187  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  54.5 
 
 
241 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.05 
 
 
279 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.33 
 
 
208 aa  181  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  56.98 
 
 
253 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.05 
 
 
237 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  55.76 
 
 
229 aa  168  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.57 
 
 
225 aa  150  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.71 
 
 
269 aa  137  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  44.77 
 
 
284 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  40.22 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  44.85 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.88 
 
 
193 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.01 
 
 
187 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  41.21 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 
181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.44 
 
 
273 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.72 
 
 
189 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.72 
 
 
534 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44 
 
 
237 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  43.12 
 
 
274 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  38.69 
 
 
209 aa  101  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  38.1 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  38.07 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.79 
 
 
197 aa  99.4  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  42.01 
 
 
184 aa  99  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 
195 aa  99  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  38.55 
 
 
194 aa  99  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.49 
 
 
196 aa  98.6  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.29 
 
 
196 aa  98.2  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  32.12 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 
184 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  39.76 
 
 
352 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  38.55 
 
 
195 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  41.48 
 
 
263 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  32.57 
 
 
179 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  41.21 
 
 
185 aa  95.9  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  39.52 
 
 
178 aa  95.5  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  37.95 
 
 
192 aa  95.5  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 
332 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  38.55 
 
 
299 aa  95.9  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 
330 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.35 
 
 
192 aa  95.1  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  34.32 
 
 
190 aa  95.1  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  28.89 
 
 
198 aa  95.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  33.73 
 
 
190 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  39.18 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  33.73 
 
 
190 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  39.31 
 
 
353 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  31.71 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  38.22 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  33.73 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  33.73 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  31.14 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 
394 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.91 
 
 
222 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  38.33 
 
 
337 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  32.92 
 
 
183 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  33.73 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  33.73 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  40.36 
 
 
360 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  31.74 
 
 
282 aa  94  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  33.73 
 
 
190 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  38.07 
 
 
256 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  38.07 
 
 
277 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  39.18 
 
 
257 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  33.73 
 
 
190 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  37.68 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  36.93 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  37.43 
 
 
287 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>