289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4629 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  351  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  85.54 
 
 		 187 aa  261  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  71.25 
 
 		 189 aa  224  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  54.86 
 
 		 274 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.43 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.38 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  45.51 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  48.43 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.58 
 
 		 273 aa  124  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  41.88 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  41.88 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  44.3 
 
 		 243 aa  123  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  39.52 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  41.88 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  39.63 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  41.88 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  41.88 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  41.88 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  41.88 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  41.88 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.84 
 
 		 252 aa  121  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  41.88 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  44.09 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  46.99 
 
 		 352 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  41.25 
 
 		 190 aa  120  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.89 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  45.4 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  46.2 
 
 		 238 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  41.88 
 
 		 190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  42.77 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  37.8 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  45.91 
 
 		 387 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  42.14 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  44.3 
 
 		 282 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  38.85 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  40.85 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  45.57 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  45.28 
 
 		 372 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.51 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.28 
 
 		 387 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  39.64 
 
 		 196 aa  115  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  38.75 
 
 		 199 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  46.95 
 
 		 238 aa  115  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.77 
 
 		 269 aa  115  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  44.3 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  38.65 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.94 
 
 		 534 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  43.31 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  43.04 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  38.12 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  39.75 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  39.88 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.5 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.96 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  41.88 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.51 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.57 
 
 		 261 aa  111  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.83 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  42.86 
 
 		 201 aa  110  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  47.13 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  40.62 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  42.42 
 
 		 284 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  44.1 
 
 		 299 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.44 
 
 		 254 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.93 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  40.12 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.14 
 
 		 224 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  44.44 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.99 
 
 		 165 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 198 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  43.27 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.14 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.53 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  41.72 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  39.63 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  35.33 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  43.32 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.91 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  43.12 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  41.18 
 
 		 385 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.62 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  42.17 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.51 
 
 		 279 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1166  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.9 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2137  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.71 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  42.17 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  42.17 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  39.38 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  42.17 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.44 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  41.14 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.67 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  43.53 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.08 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  40.62 
 
 		 231 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>