286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0756 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  49.23 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  43.01 
 
 
196 aa  165  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  44.05 
 
 
188 aa  152  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  43.33 
 
 
193 aa  151  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  43.56 
 
 
194 aa  149  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.72 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  43.65 
 
 
190 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  43.65 
 
 
190 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  43.65 
 
 
190 aa  142  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  43.65 
 
 
190 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  43.09 
 
 
190 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  43.09 
 
 
190 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  43.09 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  42.54 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
190 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  41.1 
 
 
199 aa  139  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  41.99 
 
 
190 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  41.62 
 
 
190 aa  134  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.9 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.51 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  41.25 
 
 
195 aa  124  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.06 
 
 
196 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  39.49 
 
 
198 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  40.62 
 
 
195 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  42.6 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  42.07 
 
 
181 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.62 
 
 
189 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 
168 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  36.65 
 
 
282 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  39.24 
 
 
183 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  35.88 
 
 
224 aa  106  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.97 
 
 
193 aa  105  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0601  chromosomal segregation and condensation protein B  37.36 
 
 
209 aa  103  2e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 
179 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 
184 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0353  segregation and condensation protein B  34.78 
 
 
388 aa  102  5e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.260202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.59 
 
 
190 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 
171 aa  101  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  36.2 
 
 
205 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  43.31 
 
 
318 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.42 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  39.63 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  36.02 
 
 
193 aa  99.4  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.8 
 
 
176 aa  98.6  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  37.35 
 
 
387 aa  98.2  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.52 
 
 
534 aa  97.8  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  36.75 
 
 
372 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.75 
 
 
387 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  37.14 
 
 
284 aa  97.4  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  36.2 
 
 
193 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  37.36 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  36.2 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  33.52 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.53 
 
 
192 aa  95.9  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  43.8 
 
 
221 aa  95.5  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.44 
 
 
179 aa  94.7  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  37.31 
 
 
237 aa  94.7  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.93 
 
 
211 aa  94.4  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  37.21 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  33.53 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.36 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.94 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  37.21 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1955  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 
219 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  34.55 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.65 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 
195 aa  92.8  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  42.11 
 
 
195 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.14 
 
 
269 aa  92.8  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  47.32 
 
 
242 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  35.93 
 
 
238 aa  92.8  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  35.03 
 
 
180 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  36.53 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  35.58 
 
 
251 aa  92.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf011  segregation and condensation protein B  30.98 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.04 
 
 
196 aa  92  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1582  segregation and condensation protein B  32.2 
 
 
180 aa  91.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  36.65 
 
 
394 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1551  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 
180 aa  91.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  40.31 
 
 
185 aa  91.7  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  41.3 
 
 
353 aa  91.3  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  35.54 
 
 
352 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  33.89 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  38.71 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  36.65 
 
 
343 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  36.65 
 
 
345 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  40.74 
 
 
352 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  36.65 
 
 
340 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  35.22 
 
 
302 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  36.65 
 
 
345 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  36.65 
 
 
345 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  36.02 
 
 
360 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  35.4 
 
 
311 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  41.22 
 
 
264 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.5 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  36.65 
 
 
340 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  34.39 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>