257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0601 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0601  chromosomal segregation and condensation protein B  100 
 
 
209 aa  420  1e-117  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl549  chromosomal segregation/condensation protein  55.5 
 
 
209 aa  218  7e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00308585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  38.18 
 
 
193 aa  105  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  38.22 
 
 
195 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  37.36 
 
 
201 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  36.09 
 
 
190 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  38.69 
 
 
199 aa  101  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.29 
 
 
273 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.99 
 
 
196 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.58 
 
 
187 aa  99  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  37.14 
 
 
282 aa  98.2  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  36.72 
 
 
183 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  36.31 
 
 
199 aa  95.5  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  36.09 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  35.68 
 
 
198 aa  95.1  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  36.09 
 
 
190 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  35.5 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  35.5 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  35.5 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  35.5 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  35.5 
 
 
190 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  30.77 
 
 
192 aa  91.7  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  35.5 
 
 
190 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.68 
 
 
196 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  34.44 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  35.67 
 
 
190 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  33.86 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  37.42 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.77 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.65 
 
 
225 aa  86.3  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.97 
 
 
189 aa  85.5  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  32.07 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.94 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  36.09 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  31.75 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  29.67 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  31.58 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  32.24 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.25 
 
 
206 aa  82  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 
250 aa  82  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  33.88 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  29.73 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  38.53 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  33.88 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  33.88 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  33.88 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.25 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  27.23 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  36.09 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1551  putative transcriptional regulator  36.09 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  31.11 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1582  segregation and condensation protein B  36.09 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  31.32 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  36.09 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  36 
 
 
221 aa  79  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  27.53 
 
 
274 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  36.73 
 
 
387 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.73 
 
 
387 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  36.73 
 
 
372 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 
360 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  33.54 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  33.77 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  33.77 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  31.77 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.33 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  31.77 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  33.12 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  32.69 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  33.77 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  30.99 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  33.77 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  30.85 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  31.11 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  33.77 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  33.77 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  35.45 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  33.77 
 
 
458 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  32.69 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  40.91 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  32.57 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  33.77 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.02 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  29.71 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  31.14 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  33.12 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0353  segregation and condensation protein B  31.33 
 
 
388 aa  75.9  0.0000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.260202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.38 
 
 
534 aa  75.5  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  30 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  29.41 
 
 
261 aa  75.1  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>