285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1998 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  66.85 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  62.31 
 
 		 202 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  59.78 
 
 		 201 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  60.48 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  54.27 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.21 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  37.08 
 
 		 237 aa  131  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.47 
 
 		 447 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  36.25 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  36.47 
 
 		 352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  36.32 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  35.29 
 
 		 387 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 		 372 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.29 
 
 		 387 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  36.21 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  39.16 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  44.63 
 
 		 318 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  39.16 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  36.36 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.5 
 
 		 534 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  36.47 
 
 		 195 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  36.52 
 
 		 178 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  34.66 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.55 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  34.66 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  30.85 
 
 		 299 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  35.19 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  37.65 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  34.3 
 
 		 192 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.72 
 
 		 193 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.3 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  35.39 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.52 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  35.71 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.9 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  36.42 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  34.17 
 
 		 343 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  36.81 
 
 		 340 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  34.71 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  36.81 
 
 		 345 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  36.81 
 
 		 345 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  36.2 
 
 		 340 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  36.81 
 
 		 345 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 349 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  34.83 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  37.27 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 456 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 458 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 455 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 456 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  37.87 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.53 
 
 		 187 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  34.57 
 
 		 171 aa  105  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.52 
 
 		 200 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  39.52 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  36.75 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  36.13 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  34.16 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  36.52 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  36.02 
 
 		 394 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1016  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.31 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  34.88 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.38 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0353  segregation and condensation protein B  33.93 
 
 		 388 aa  101  7e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.260202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  34.68 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  34.94 
 
 		 171 aa  101  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  36.82 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  37.57 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  32.52 
 
 		 311 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  37.72 
 
 		 385 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  37.57 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  37.57 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  35.47 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  37.57 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  32.73 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.84 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  33.15 
 
 		 352 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.25 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  35.4 
 
 		 408 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  37.57 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  32.7 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  32.94 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  39.84 
 
 		 337 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  36.69 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  38.12 
 
 		 185 aa  99.4  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.24 
 
 		 389 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  32.73 
 
 		 280 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  34.31 
 
 		 190 aa  99.4  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  35.12 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  41.09 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>