281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4409 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  474  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  59.63 
 
 		 385 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  60 
 
 		 432 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  61.11 
 
 		 389 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  60.1 
 
 		 358 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  59.42 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  60.51 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  55.17 
 
 		 248 aa  234  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  67.18 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  57.35 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  58.03 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  54.71 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  54.71 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  57.5 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  60.55 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  60.85 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  60.56 
 
 		 254 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.2 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  56.25 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  52.15 
 
 		 242 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  48.82 
 
 		 226 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  50.79 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  51.85 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  52.41 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  45.71 
 
 		 211 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  47.55 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  54.17 
 
 		 269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  50.84 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  46.57 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  51.48 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  45.91 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  58.78 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  52.58 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 185 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.03 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.9 
 
 		 534 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.71 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  44.97 
 
 		 195 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  42.33 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  39.52 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.64 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  36.32 
 
 		 214 aa  118  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  36.97 
 
 		 193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  38.65 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  39.51 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  39.51 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  39.51 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  36.36 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  37.5 
 
 		 222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  42.51 
 
 		 195 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.61 
 
 		 196 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  39.63 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  38.32 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  39.02 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  38.32 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.32 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  38.5 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  41.58 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  34.71 
 
 		 197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  38.92 
 
 		 340 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  37.5 
 
 		 399 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  36.9 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  39.75 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  38.14 
 
 		 458 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  39.75 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  36.78 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  39.75 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  34.46 
 
 		 250 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  39.75 
 
 		 343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  38.65 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  35.23 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0086  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  38.76 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  37.7 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  37.7 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  37.7 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  43.24 
 
 		 210 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  37.7 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  34.64 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  33.65 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  39.51 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  37.7 
 
 		 455 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.1 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  37.7 
 
 		 456 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  37.7 
 
 		 456 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.41 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.62 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  37.34 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  39.16 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  39.24 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  34.29 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  38.79 
 
 		 194 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  38.75 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>