281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1910 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  100 
 
 
269 aa  534  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  59.67 
 
 
385 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  56.98 
 
 
248 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  54.95 
 
 
389 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  55.49 
 
 
432 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  62.72 
 
 
239 aa  208  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  58.14 
 
 
256 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  53.85 
 
 
358 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  55.81 
 
 
248 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  50.67 
 
 
242 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  59.51 
 
 
216 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.84 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  59.34 
 
 
260 aa  198  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  51.78 
 
 
221 aa  192  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.7 
 
 
220 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  57.74 
 
 
229 aa  188  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  56.14 
 
 
211 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  54.59 
 
 
242 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  54.59 
 
 
241 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  54.59 
 
 
241 aa  185  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  52.6 
 
 
211 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  53.42 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  54.39 
 
 
226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  52.43 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  56.02 
 
 
215 aa  182  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  53.3 
 
 
242 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  54.65 
 
 
228 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.17 
 
 
238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  55.1 
 
 
244 aa  178  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  53.65 
 
 
238 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  59.42 
 
 
195 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  57.73 
 
 
218 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  50.89 
 
 
197 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  54.66 
 
 
252 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  49.06 
 
 
185 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.13 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  42.7 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  42.42 
 
 
209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  42.42 
 
 
209 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.06 
 
 
197 aa  129  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  38.54 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  38.67 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  40 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  40.24 
 
 
197 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 
254 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  40.91 
 
 
247 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  40.72 
 
 
198 aa  125  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  39.16 
 
 
352 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.44 
 
 
534 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  42.77 
 
 
236 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  45.12 
 
 
201 aa  122  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  44.03 
 
 
184 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  42.42 
 
 
195 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  40.24 
 
 
198 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  39.88 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  40.24 
 
 
198 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  40.24 
 
 
198 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  40.24 
 
 
198 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  39.46 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  39.34 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.91 
 
 
198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  37.91 
 
 
198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  37.91 
 
 
198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  39.63 
 
 
198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  39.18 
 
 
214 aa  118  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  41.36 
 
 
372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.36 
 
 
387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.61 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  40.83 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  41.72 
 
 
178 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  40.74 
 
 
387 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  38.04 
 
 
210 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  41.98 
 
 
352 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  42.01 
 
 
195 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  38.76 
 
 
360 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  42.07 
 
 
195 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  40.36 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  40 
 
 
194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  40.61 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  39.29 
 
 
455 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  38.24 
 
 
349 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  39.29 
 
 
456 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  39.29 
 
 
456 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  35.26 
 
 
193 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 
192 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.86 
 
 
200 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  41.36 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  38.82 
 
 
458 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.77 
 
 
192 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  40.25 
 
 
442 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  40.25 
 
 
442 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  40.25 
 
 
442 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  40.25 
 
 
442 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  41.36 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  38.15 
 
 
408 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  36.98 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 
206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>