277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0498 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  63.59 
 
 		 385 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  65.95 
 
 		 389 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  64.86 
 
 		 432 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  65.41 
 
 		 358 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  65.95 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  67.03 
 
 		 256 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  65.95 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  59.69 
 
 		 242 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  64.42 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  62.81 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  60.66 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  60.38 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  59.91 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  63.59 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  62.89 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  62.68 
 
 		 220 aa  224  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.54 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  62.05 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  52.53 
 
 		 211 aa  208  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  52.53 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  52.53 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  53.33 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  52.71 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  52.94 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  61.31 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  55.5 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  52.59 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  51.6 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  59.04 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  51.37 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  55.61 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  61.15 
 
 		 195 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  51.48 
 
 		 197 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.26 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  46.51 
 
 		 185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.61 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.38 
 
 		 534 aa  128  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  35.39 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  39.88 
 
 		 193 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  42.59 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  38.66 
 
 		 340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  39.29 
 
 		 193 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  39.2 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  39.2 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  41.14 
 
 		 226 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  38.51 
 
 		 197 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  38.42 
 
 		 399 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  39.41 
 
 		 352 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  41.21 
 
 		 345 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  41.21 
 
 		 345 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  41.21 
 
 		 345 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  41.21 
 
 		 343 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  39.57 
 
 		 340 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  41.18 
 
 		 442 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  41.18 
 
 		 442 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  41.18 
 
 		 442 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 		 198 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  41.18 
 
 		 442 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  38.32 
 
 		 198 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  40.61 
 
 		 349 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  40.61 
 
 		 456 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  36.93 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  40.61 
 
 		 458 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  40.61 
 
 		 455 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  40.61 
 
 		 456 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.67 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  43.03 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  37.64 
 
 		 198 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.24 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  37.64 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  37.64 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  37.64 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  39.11 
 
 		 201 aa  119  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  39.26 
 
 		 178 aa  118  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  39.02 
 
 		 209 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  37.14 
 
 		 291 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  43.57 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  40.36 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  39.02 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  39.52 
 
 		 184 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  38.37 
 
 		 206 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  40.49 
 
 		 394 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.32 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  39.39 
 
 		 360 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 		 210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2319  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.62874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  37.95 
 
 		 195 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  37.95 
 
 		 195 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  39.26 
 
 		 408 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  40.61 
 
 		 221 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  39.64 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  35.53 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>