283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3120 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  100 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  62.94 
 
 		 385 aa  238  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  61.58 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  63.68 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  60.53 
 
 		 389 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  59.47 
 
 		 358 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  59.47 
 
 		 432 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  60.85 
 
 		 248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  64.61 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  57.07 
 
 		 221 aa  208  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  55.32 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  56.85 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  60 
 
 		 269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  56.12 
 
 		 242 aa  194  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  61.26 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  56.35 
 
 		 241 aa  192  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  61.21 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  55.87 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  56.35 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  55.87 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  52 
 
 		 226 aa  191  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  57.29 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  56.4 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  56.02 
 
 		 228 aa  187  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  51.98 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.61 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  55.61 
 
 		 238 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  53.12 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  52.58 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.74 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.22 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  62.04 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  56.88 
 
 		 252 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  58.59 
 
 		 218 aa  161  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  52.5 
 
 		 185 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.88 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  38.04 
 
 		 352 aa  128  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  42.86 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.37 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  40.59 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.78 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.54 
 
 		 534 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  41.57 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  38.67 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  43.83 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  45.03 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  37.85 
 
 		 198 aa  118  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.06 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  44.19 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  37.31 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  39.38 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  39.77 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  39.77 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  39.77 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  41.04 
 
 		 256 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  38.75 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  40.78 
 
 		 442 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  40.78 
 
 		 442 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  40.1 
 
 		 343 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  40.78 
 
 		 442 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  40.78 
 
 		 458 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  40.78 
 
 		 442 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.85 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  40.78 
 
 		 455 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  38.82 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  41.61 
 
 		 254 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  43.9 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  41.28 
 
 		 345 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  40.78 
 
 		 456 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  40.78 
 
 		 456 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 340 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  42.07 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  41.28 
 
 		 340 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  42.07 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 345 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 345 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  46.43 
 
 		 195 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  41.28 
 
 		 349 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  42.01 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  39.2 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  40.85 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  40.32 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  41.8 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  38.92 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  38.46 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  39.41 
 
 		 360 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  37.78 
 
 		 291 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  41.92 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  36.87 
 
 		 245 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  41.38 
 
 		 263 aa  111  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  40.59 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  39.02 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  40.7 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  39.13 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>