278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1162 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  73.04 
 
 		 238 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  73.48 
 
 		 238 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  71.81 
 
 		 238 aa  299  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  59.43 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  59.5 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  63.51 
 
 		 241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  63.03 
 
 		 241 aa  252  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  56.1 
 
 		 385 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  57.89 
 
 		 358 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  57.89 
 
 		 389 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  55.17 
 
 		 248 aa  238  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  55.36 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  55.79 
 
 		 248 aa  231  9e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  54.74 
 
 		 432 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  60.54 
 
 		 221 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  56.41 
 
 		 211 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  65.19 
 
 		 254 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  55.9 
 
 		 211 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  65.17 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  52.15 
 
 		 242 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  52.75 
 
 		 229 aa  214  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  55.9 
 
 		 211 aa  214  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  58.29 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.44 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  54.92 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  50.7 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  56.12 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  50 
 
 		 215 aa  192  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  55.78 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  52.04 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  52.48 
 
 		 269 aa  174  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  55.21 
 
 		 252 aa  174  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  59.12 
 
 		 195 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  46.59 
 
 		 185 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.92 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.15 
 
 		 197 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.79 
 
 		 196 aa  124  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.77 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  40.91 
 
 		 399 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.19 
 
 		 534 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  36.53 
 
 		 352 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  37.43 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  37.78 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  37.78 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  36.84 
 
 		 193 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  38.37 
 
 		 291 aa  118  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  36.97 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  36.9 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  37.72 
 
 		 184 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.37 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  34.71 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  45.6 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  36.59 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  40.85 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  34.71 
 
 		 197 aa  112  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  39.39 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  35.2 
 
 		 337 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  37.06 
 
 		 198 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  35.68 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0086  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  36.47 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.52 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  39.52 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  36.47 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  41.88 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  35.18 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 		 259 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 		 221 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  37.28 
 
 		 244 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  37.87 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  38.24 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  41.98 
 
 		 360 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  35.88 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  41.22 
 
 		 442 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  41.22 
 
 		 345 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  41.22 
 
 		 340 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  41.22 
 
 		 442 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  41.22 
 
 		 345 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  41.22 
 
 		 442 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  37.72 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  41.22 
 
 		 340 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  41.22 
 
 		 442 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  41.22 
 
 		 345 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  33.54 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  41.22 
 
 		 456 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  41.22 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  41.22 
 
 		 458 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  41.22 
 
 		 456 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  37.13 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  44.19 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  41.22 
 
 		 455 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  39.52 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  37.2 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  37.13 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>