281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2707 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  100 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  60.61 
 
 		 385 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  62.75 
 
 		 358 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  62.75 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  61.29 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  58.54 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  61.29 
 
 		 432 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.78 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  57.32 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  45.91 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  56.52 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  54.55 
 
 		 221 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  61.63 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  48.4 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  55 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  55 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  57.4 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  47.42 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  58.28 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  59.64 
 
 		 238 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.43 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  55.21 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  47.42 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  46.81 
 
 		 211 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  46.28 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  49.1 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  56.63 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.61 
 
 		 220 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  56.88 
 
 		 216 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  51.88 
 
 		 215 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  50.31 
 
 		 197 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  54.66 
 
 		 269 aa  154  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  54.62 
 
 		 195 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  56.44 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.67 
 
 		 231 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  45.68 
 
 		 185 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  40.34 
 
 		 178 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  37.5 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  37.5 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  37.5 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.75 
 
 		 197 aa  123  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  39 
 
 		 198 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39 
 
 		 198 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  39 
 
 		 198 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  42.7 
 
 		 198 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  40.46 
 
 		 352 aa  121  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  37 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  38.64 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  36.41 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  38.37 
 
 		 197 aa  118  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  39.33 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  40.12 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  38.69 
 
 		 184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  39.33 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  39.66 
 
 		 222 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  40.57 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.24 
 
 		 534 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  37.5 
 
 		 343 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  39.76 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  39.66 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  42.68 
 
 		 201 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  38.33 
 
 		 345 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 345 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 345 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  38.33 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.81 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.35 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.04 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  38.07 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  37.78 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  38.07 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 		 455 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  38.33 
 
 		 458 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  41.56 
 
 		 210 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  38.33 
 
 		 442 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  38.33 
 
 		 442 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  38.33 
 
 		 442 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  38.33 
 
 		 442 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  37.22 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  39.64 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 360 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  38.33 
 
 		 456 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  38.33 
 
 		 456 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  40.24 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  32.42 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  35.59 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.38 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 		 183 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  42.07 
 
 		 195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  38.32 
 
 		 311 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  32.42 
 
 		 209 aa  109  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 		 195 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  38.65 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  34.81 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>