276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3190 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  100 
 
 
432 aa  831    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  71.03 
 
 
358 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  73.8 
 
 
389 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  81.01 
 
 
385 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  78.91 
 
 
248 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  83.12 
 
 
248 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  79.76 
 
 
256 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  60.1 
 
 
242 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  61.81 
 
 
244 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  61.43 
 
 
242 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  60.18 
 
 
238 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  66.3 
 
 
260 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  58.26 
 
 
241 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  58.26 
 
 
241 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  60.98 
 
 
220 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  63.4 
 
 
254 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.38 
 
 
238 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  58.38 
 
 
238 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  63.91 
 
 
239 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  53.11 
 
 
242 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  59.43 
 
 
211 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  60.98 
 
 
218 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  57.8 
 
 
221 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  56.52 
 
 
211 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  56.52 
 
 
211 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  58.93 
 
 
229 aa  204  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  59.9 
 
 
216 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  56.57 
 
 
226 aa  200  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  56.65 
 
 
228 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  56.32 
 
 
215 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  61.21 
 
 
252 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  56.54 
 
 
269 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  52.07 
 
 
197 aa  176  9e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  59.26 
 
 
195 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.85 
 
 
231 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  47.9 
 
 
185 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  44.89 
 
 
399 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.96 
 
 
534 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.26 
 
 
197 aa  133  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  44.25 
 
 
221 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  47.1 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  41.71 
 
 
291 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  40.99 
 
 
250 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  40.96 
 
 
201 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  42.24 
 
 
343 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  41.61 
 
 
456 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  42.24 
 
 
345 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  41.61 
 
 
442 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  41.61 
 
 
456 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  42.24 
 
 
340 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  41.61 
 
 
442 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  42.24 
 
 
345 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  41.61 
 
 
442 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  42.24 
 
 
345 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 
360 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  41.61 
 
 
442 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  41.48 
 
 
247 aa  123  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  41.61 
 
 
458 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  41.61 
 
 
455 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  41.48 
 
 
254 aa  123  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  42.24 
 
 
340 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  41.18 
 
 
226 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  41.61 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  43.37 
 
 
178 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  38.86 
 
 
198 aa  120  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  42.07 
 
 
209 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  42.07 
 
 
209 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  40.8 
 
 
198 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  40.8 
 
 
198 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  41.98 
 
 
254 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  40.8 
 
 
198 aa  118  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  38.82 
 
 
299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  41.25 
 
 
302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  40.74 
 
 
197 aa  117  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.25 
 
 
228 aa  117  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  40.8 
 
 
198 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  40.96 
 
 
198 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  40.99 
 
 
311 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  40.25 
 
 
408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  40.8 
 
 
198 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
214 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  40.8 
 
 
198 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.8 
 
 
198 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  40.8 
 
 
198 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 
210 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  40.96 
 
 
236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  40.35 
 
 
184 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  39.77 
 
 
206 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  41.92 
 
 
245 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  38.69 
 
 
222 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.51 
 
 
234 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  40.85 
 
 
195 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  39.51 
 
 
234 aa  113  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  41.07 
 
 
274 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  40.99 
 
 
246 aa  113  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.25 
 
 
200 aa  113  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 
198 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  41.52 
 
 
243 aa  112  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  39.74 
 
 
210 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>