281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1486 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  100 
 
 
238 aa  473  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  94.96 
 
 
238 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  79.53 
 
 
238 aa  311  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  73.48 
 
 
242 aa  310  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  69.86 
 
 
244 aa  268  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  68.12 
 
 
242 aa  261  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  63.04 
 
 
241 aa  255  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  62.61 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  61.58 
 
 
358 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  61.58 
 
 
389 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  58.88 
 
 
385 aa  245  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  59.61 
 
 
256 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  59.47 
 
 
248 aa  239  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  58.42 
 
 
432 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  58.42 
 
 
248 aa  236  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  56.25 
 
 
242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  60.2 
 
 
220 aa  214  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  63.19 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  58.96 
 
 
211 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  55.1 
 
 
211 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  53.73 
 
 
211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  54.23 
 
 
221 aa  198  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  57.8 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  60.12 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  53.4 
 
 
229 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  55.49 
 
 
226 aa  187  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  57.23 
 
 
215 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  55.61 
 
 
216 aa  185  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  59.89 
 
 
260 aa  185  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  56.86 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  59.64 
 
 
252 aa  175  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  49.21 
 
 
197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  53.65 
 
 
269 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  61.83 
 
 
195 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50 
 
 
231 aa  154  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  48.8 
 
 
185 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  39.41 
 
 
352 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.28 
 
 
534 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.86 
 
 
197 aa  125  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  41.07 
 
 
193 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  42.37 
 
 
399 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  40.48 
 
 
193 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  41.21 
 
 
206 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  38.8 
 
 
291 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  40.33 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  40.33 
 
 
247 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  40.24 
 
 
178 aa  118  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  41.07 
 
 
222 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.59 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.33 
 
 
228 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.18 
 
 
200 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  42.36 
 
 
210 aa  115  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  42.17 
 
 
195 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  36.59 
 
 
197 aa  114  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
372 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  40.74 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.67 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  40.72 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.72 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  42.68 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  38.55 
 
 
198 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  41.07 
 
 
387 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  38.55 
 
 
198 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  38.55 
 
 
198 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  38.55 
 
 
198 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  35.88 
 
 
198 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  37.65 
 
 
184 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.46 
 
 
192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  33.92 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  33.92 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 
442 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 
442 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 
458 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 
442 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  39.39 
 
 
345 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  37.31 
 
 
340 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 
345 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 
340 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 
345 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 
442 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  38.79 
 
 
343 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  36.07 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  43.12 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  38.55 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 
455 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  39.16 
 
 
456 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  36.84 
 
 
282 aa  109  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  39.16 
 
 
456 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  38.73 
 
 
287 aa  108  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 
245 aa  109  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  35.38 
 
 
226 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  34.01 
 
 
210 aa  108  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  38.18 
 
 
360 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.53 
 
 
198 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  36.53 
 
 
198 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  36.53 
 
 
198 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>