288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1866 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  431  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  71.23 
 
 		 211 aa  297  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  70.89 
 
 		 211 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  70.28 
 
 		 211 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  70.73 
 
 		 228 aa  285  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  69.08 
 
 		 226 aa  284  8e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  67.86 
 
 		 229 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  55.79 
 
 		 385 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  60.77 
 
 		 242 aa  204  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  58.7 
 
 		 241 aa  203  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  58.7 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  62.16 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  59.76 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  60.54 
 
 		 242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  58.58 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  55.22 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  58.28 
 
 		 389 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  58.28 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  55.05 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  61.35 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  57.67 
 
 		 358 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  57.07 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  60.34 
 
 		 238 aa  185  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.55 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  56.89 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.33 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  57.78 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  51.18 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.62 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  52.54 
 
 		 252 aa  168  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  51.78 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  52.9 
 
 		 195 aa  161  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  56.18 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.06 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.93 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.44 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  35.61 
 
 		 291 aa  121  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  36.9 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  41.62 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  40.48 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  39.2 
 
 		 399 aa  118  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  35.93 
 
 		 352 aa  118  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  40.48 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.26 
 
 		 534 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  37.5 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.52 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  35.71 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  39.29 
 
 		 259 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  40.24 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  36.26 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 299 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  38.69 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  39.88 
 
 		 337 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  38.69 
 
 		 257 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 		 236 aa  111  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  36.36 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  36.36 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  36.36 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  36.36 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  37.58 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  39.53 
 
 		 264 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  42.51 
 
 		 195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  37.58 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  38.6 
 
 		 178 aa  108  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  40.74 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.76 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  35.76 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  35.76 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  35.76 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  35.76 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  34.52 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  41.25 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  38.69 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.24 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  33.93 
 
 		 193 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  39.29 
 
 		 332 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 330 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  36.36 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  37.27 
 
 		 349 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  44.78 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  36.81 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  41.13 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4816  putative transcriptional regulator  37.31 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  37.85 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  36.31 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 		 340 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  43.2 
 
 		 302 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 340 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  36.31 
 
 		 408 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  36.75 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>