287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0906 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  92.89 
 
 		 211 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  92.89 
 
 		 211 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  78.37 
 
 		 226 aa  322  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  76.33 
 
 		 229 aa  317  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  80.98 
 
 		 228 aa  310  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  73.27 
 
 		 221 aa  295  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  55.72 
 
 		 385 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  61.36 
 
 		 260 aa  205  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  61.45 
 
 		 242 aa  205  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  61.54 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  57.87 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  57.87 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  57.71 
 
 		 256 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  56.35 
 
 		 432 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  59.39 
 
 		 358 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  56.57 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  59.39 
 
 		 389 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  56.91 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  57.22 
 
 		 244 aa  201  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  56.41 
 
 		 242 aa  198  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  60.12 
 
 		 238 aa  187  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  58.16 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  56.89 
 
 		 215 aa  184  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56 
 
 		 254 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  58.96 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  55.32 
 
 		 216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.82 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  54.12 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  45.71 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  48.4 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  56.14 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  54.19 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  55.17 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  48.12 
 
 		 185 aa  147  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  39.6 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.12 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  43.71 
 
 		 399 aa  125  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  36.53 
 
 		 352 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.35 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  41.01 
 
 		 254 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.76 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  43.02 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  40.48 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  41.01 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  41.21 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  37.5 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  39.63 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  39.13 
 
 		 349 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  39.63 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.95 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  40.24 
 
 		 178 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  36.97 
 
 		 197 aa  112  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 		 255 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  38.92 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  36.81 
 
 		 254 aa  111  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  40.59 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 		 345 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  38.51 
 
 		 345 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  37.87 
 
 		 360 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 		 340 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  38.51 
 
 		 345 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  38.79 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 		 442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 		 442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 		 442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  38.18 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 		 458 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 		 442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  38.18 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  38.18 
 
 		 340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 		 456 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 		 455 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  38.79 
 
 		 255 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 		 456 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  37.27 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  35.43 
 
 		 245 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  38.79 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  36.26 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  37.58 
 
 		 337 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  37.57 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  38.1 
 
 		 408 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  38.2 
 
 		 311 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  38.18 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  35.12 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  35.12 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2319  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.62874  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  37.58 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  40.13 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  38.18 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  38.18 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  38.18 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  37.71 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.71 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.32 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.52 
 
 		 534 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  36.5 
 
 		 263 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  38.85 
 
 		 394 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  33.16 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>