279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2670 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  79.53 
 
 		 238 aa  314  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  79.53 
 
 		 238 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  71.81 
 
 		 242 aa  299  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  65.93 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  68.29 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  64 
 
 		 385 aa  258  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  65.26 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  64.25 
 
 		 241 aa  254  9e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  65.26 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  65.5 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  65.26 
 
 		 389 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  63.8 
 
 		 241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  63.16 
 
 		 432 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  63.68 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  57.35 
 
 		 242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.73 
 
 		 220 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  60.61 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  58.16 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  60.34 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  57.14 
 
 		 211 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  57.14 
 
 		 211 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  59.69 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  57.14 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  58.96 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  61.26 
 
 		 216 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  54.97 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  60 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  60.71 
 
 		 218 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  57.8 
 
 		 226 aa  191  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  53.6 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  58.28 
 
 		 252 aa  174  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  54.71 
 
 		 197 aa  174  9e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  61.31 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.49 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  41.48 
 
 		 399 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  40.96 
 
 		 352 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  38.82 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  38.82 
 
 		 193 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.11 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  35.84 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.24 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  39.29 
 
 		 222 aa  119  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.01 
 
 		 534 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  36.13 
 
 		 198 aa  119  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  38.51 
 
 		 197 aa  118  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  41.46 
 
 		 178 aa  118  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  37.8 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.9 
 
 		 387 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  43.9 
 
 		 387 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  39.76 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  40.12 
 
 		 198 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  43.9 
 
 		 372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  37.8 
 
 		 209 aa  116  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  43.03 
 
 		 234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.03 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  40.12 
 
 		 198 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  40.12 
 
 		 198 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  40.12 
 
 		 198 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  36.41 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  42.59 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  36.5 
 
 		 343 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  39.01 
 
 		 291 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  38.92 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  40.12 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.51 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  39.52 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4583  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  37.87 
 
 		 340 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  37.87 
 
 		 340 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  37.87 
 
 		 345 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  37.87 
 
 		 345 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  37.87 
 
 		 345 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  38.24 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  45.73 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.31 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  40.99 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 198 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 198 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.41 
 
 		 198 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 198 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  37.87 
 
 		 349 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 198 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  37.28 
 
 		 360 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0086  putative transcriptional regulator  41.07 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  35.89 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  35.53 
 
 		 442 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  35.53 
 
 		 442 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7277  hypothetical protein  41.24 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4816  putative transcriptional regulator  39.89 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4800  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  35.53 
 
 		 442 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  34.76 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  35.53 
 
 		 442 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>