261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4816 on replicon NC_009670
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009670  Oant_4816  putative transcriptional regulator  100 
 
 
228 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7277  hypothetical protein  81.14 
 
 
228 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8008  hypothetical protein  76.53 
 
 
231 aa  333  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915827  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4574  putative transcriptional regulator  64.42 
 
 
231 aa  274  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4550  putative transcriptional regulator  64.95 
 
 
245 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4197  condensin subunit ScpB  63.37 
 
 
229 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323674  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9010  hypothetical protein  88.81 
 
 
149 aa  255  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4800  putative transcriptional regulator  65.1 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4583  putative transcriptional regulator  63.68 
 
 
232 aa  250  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4509  putative transcriptional regulator  57.29 
 
 
236 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.831717  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3753  chromosome segregation and condensation protein ScpB  54.45 
 
 
205 aa  205  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352039  normal  0.566096 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4029  chromosome segregation and condensation protein ScpB  54.45 
 
 
205 aa  205  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2840  chromosome segregation and condensation protein ScpB  48.65 
 
 
223 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3788  chromosome segregation and condensation protein ScpB  53.89 
 
 
221 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490073  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3402  putative transcriptional regulator  55.08 
 
 
196 aa  198  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0776378  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4232  hypothetical protein  55.68 
 
 
197 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  41.04 
 
 
226 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  39.44 
 
 
385 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  37.44 
 
 
221 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  37.77 
 
 
211 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  39.89 
 
 
238 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  36.7 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  36.7 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  39.27 
 
 
228 aa  98.6  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 
242 aa  97.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  37.31 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 
241 aa  95.1  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  35.58 
 
 
432 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  37.65 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  39.29 
 
 
241 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  36.02 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  34.71 
 
 
215 aa  92  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.38 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  36.21 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  36.2 
 
 
256 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.72 
 
 
254 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  35.98 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  36.99 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  32.14 
 
 
311 aa  89  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  34.36 
 
 
358 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 
185 aa  88.2  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.36 
 
 
389 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  31.72 
 
 
442 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  31.72 
 
 
442 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  31.72 
 
 
458 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  31.72 
 
 
442 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  31.38 
 
 
345 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  31.72 
 
 
442 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  31.38 
 
 
345 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  31.38 
 
 
345 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  31.72 
 
 
456 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  31.72 
 
 
456 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  30.61 
 
 
343 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  31.72 
 
 
455 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  31.38 
 
 
340 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  35.93 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  34.5 
 
 
197 aa  86.3  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  31.38 
 
 
340 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  30.49 
 
 
178 aa  85.5  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  30.85 
 
 
349 aa  85.1  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  32.8 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.33 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  37.5 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  30.21 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  30.21 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  35.26 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  33.54 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  30.11 
 
 
360 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  35.15 
 
 
201 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  29.82 
 
 
280 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  30.41 
 
 
302 aa  81.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  36.36 
 
 
195 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.88 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  32.35 
 
 
206 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  34.13 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  29.24 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.93 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.48 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  32.53 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  36.31 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  35.29 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  32.31 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  30.99 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  32.31 
 
 
198 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  32.31 
 
 
198 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  32.31 
 
 
198 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.56 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  30.86 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  34.73 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  31.38 
 
 
183 aa  77.8  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  29.63 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  30 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  30.59 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  32.11 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.93 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>