286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0493 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  100 
 
 
202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  62.31 
 
 
221 aa  259  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  63.27 
 
 
213 aa  257  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  58.95 
 
 
201 aa  234  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  62.5 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  53.57 
 
 
206 aa  216  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.77 
 
 
447 aa  131  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  34.2 
 
 
237 aa  128  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.23 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  38.65 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  39.33 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  35.23 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.65 
 
 
534 aa  119  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  34.03 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  40.32 
 
 
195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  35.96 
 
 
183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  33.51 
 
 
299 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.51 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  40.45 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  35.8 
 
 
195 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  35.8 
 
 
195 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  39.89 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.12 
 
 
269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  37.36 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  36.99 
 
 
190 aa  111  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 
190 aa  111  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  36.42 
 
 
190 aa  111  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  41.18 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  37.57 
 
 
190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  39.63 
 
 
171 aa  109  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 
190 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 
190 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 
190 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 
190 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.76 
 
 
273 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 
190 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 
190 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  37.57 
 
 
250 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  34.71 
 
 
352 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  35.54 
 
 
195 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  33.9 
 
 
178 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 
242 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  41.01 
 
 
189 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  33.15 
 
 
284 aa  106  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  33.53 
 
 
387 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  40.24 
 
 
385 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.52 
 
 
200 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  37.5 
 
 
197 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  32.94 
 
 
372 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  36.46 
 
 
198 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  36.99 
 
 
198 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  40.59 
 
 
195 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.82 
 
 
196 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.94 
 
 
387 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 
442 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 
442 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 
458 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 
442 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 
442 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 
455 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 
456 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 
456 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 
345 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  43.07 
 
 
221 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  36.2 
 
 
343 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 
340 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.24 
 
 
225 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  36.2 
 
 
345 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  38.15 
 
 
210 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  36.2 
 
 
340 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  36.14 
 
 
209 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  35.84 
 
 
214 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  36.2 
 
 
345 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  41.72 
 
 
210 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  36.14 
 
 
209 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  36.99 
 
 
226 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  35.12 
 
 
171 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.77 
 
 
190 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  33.33 
 
 
206 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  35.58 
 
 
349 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  35.88 
 
 
206 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  43.85 
 
 
248 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  36.02 
 
 
360 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 
168 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  34.12 
 
 
184 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  34.07 
 
 
352 aa  101  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.4 
 
 
187 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1016  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.93 
 
 
194 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 
248 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  43.48 
 
 
432 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  34.78 
 
 
394 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  36.72 
 
 
201 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  36.57 
 
 
198 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  34.66 
 
 
221 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  36.57 
 
 
198 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  35.59 
 
 
245 aa  99.8  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  33.74 
 
 
199 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  36.57 
 
 
198 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  33.75 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  34.15 
 
 
241 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>