288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1024 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
176 aa  347  4e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.92 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  38.92 
 
 
192 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  40.78 
 
 
195 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  41.18 
 
 
195 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  37.13 
 
 
171 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.13 
 
 
189 aa  122  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  42.6 
 
 
183 aa  121  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  37.04 
 
 
195 aa  120  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  38.86 
 
 
181 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  39.53 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  36.2 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.01 
 
 
273 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  34.13 
 
 
299 aa  118  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  39.77 
 
 
198 aa  119  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  36.69 
 
 
284 aa  117  6e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.4 
 
 
196 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  35.26 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  36.78 
 
 
190 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  35.26 
 
 
190 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  35.26 
 
 
190 aa  114  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  35.26 
 
 
190 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  35.26 
 
 
190 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  36.78 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  36.78 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  35.26 
 
 
190 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  33.95 
 
 
195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.27 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  38.69 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.04 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  36.53 
 
 
189 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.86 
 
 
187 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  34.68 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.53 
 
 
193 aa  111  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  38.31 
 
 
184 aa  111  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.76 
 
 
269 aa  110  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  41.46 
 
 
199 aa  110  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  36.42 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  32.18 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  47.58 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.5 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  37.28 
 
 
274 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  36.88 
 
 
179 aa  108  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  34.13 
 
 
282 aa  107  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  35.5 
 
 
189 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  40.26 
 
 
196 aa  106  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  32.72 
 
 
206 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  32.34 
 
 
237 aa  105  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.39 
 
 
196 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  33.73 
 
 
206 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  36.88 
 
 
201 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.9 
 
 
252 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  38.16 
 
 
187 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.95 
 
 
279 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.52 
 
 
193 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.5 
 
 
225 aa  101  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  35.5 
 
 
236 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  32.52 
 
 
252 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0353  segregation and condensation protein B  37.13 
 
 
388 aa  100  9e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.260202  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  32.53 
 
 
201 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  35.98 
 
 
202 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  37.27 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  32.75 
 
 
214 aa  99.8  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  31.55 
 
 
231 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.42 
 
 
211 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  31.55 
 
 
231 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 
243 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  31.55 
 
 
231 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  38.69 
 
 
353 aa  99  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.13 
 
 
205 aa  99  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  33.73 
 
 
198 aa  98.6  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 
198 aa  98.6  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.52 
 
 
254 aa  98.6  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  37.8 
 
 
201 aa  98.6  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  33.73 
 
 
198 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  33.73 
 
 
198 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  33.73 
 
 
198 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  31.98 
 
 
231 aa  97.8  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0086  putative transcriptional regulator  33.54 
 
 
216 aa  97.8  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.36 
 
 
174 aa  97.8  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  32.16 
 
 
226 aa  97.8  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  35.53 
 
 
194 aa  97.8  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2137  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.69 
 
 
173 aa  97.8  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.73 
 
 
198 aa  97.4  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  36.53 
 
 
209 aa  97.4  8e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 
198 aa  97.8  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 
198 aa  97.4  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 
198 aa  97.4  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 
198 aa  97.4  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  30 
 
 
372 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  30.43 
 
 
387 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  31.93 
 
 
352 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30 
 
 
387 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1166  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.41 
 
 
209 aa  97.1  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 
245 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  32.52 
 
 
241 aa  96.7  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.1 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 
238 aa  96.3  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 
250 aa  96.7  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  29.81 
 
 
205 aa  96.3  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>