82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1365 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
147 aa  308  2e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  54.55 
 
 
161 aa  167  5e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  41.5 
 
 
165 aa  106  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  41.5 
 
 
161 aa  101  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  37.33 
 
 
165 aa  99  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0633  dual specificity protein phosphatase  38.67 
 
 
163 aa  95.1  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0827335  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  30.67 
 
 
162 aa  84  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  31.21 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  31.13 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  31.43 
 
 
182 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.91 
 
 
508 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  35.16 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  33.08 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  31.54 
 
 
507 aa  63.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  33.57 
 
 
209 aa  63.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  30.83 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  26.49 
 
 
197 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  28.7 
 
 
370 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  30.37 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  33.09 
 
 
419 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  34.55 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.11 
 
 
505 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  29 
 
 
562 aa  54.7  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  35.25 
 
 
369 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  43.75 
 
 
550 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  31.58 
 
 
185 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  35.44 
 
 
552 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  26.72 
 
 
438 aa  53.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
500 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  28.47 
 
 
165 aa  53.5  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  30.66 
 
 
170 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  30.85 
 
 
545 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  31.93 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2580  dual specificity protein phosphatase  29.25 
 
 
183 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254118  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.57 
 
 
490 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43165  predicted protein  30.63 
 
 
269 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  28.06 
 
 
188 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_52425  predicted protein  29.35 
 
 
298 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  45.61 
 
 
547 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  29.79 
 
 
581 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04770  phosphoprotein phosphatase, putative  42.59 
 
 
761 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00163033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  30.11 
 
 
533 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  31.11 
 
 
540 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  29.17 
 
 
565 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  36.56 
 
 
478 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34403  predicted protein  28.24 
 
 
232 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  26.71 
 
 
164 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05057  protein-tyrosine phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12250)  30.11 
 
 
595 aa  47  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000599023  hitchhiker  0.0000000000000767856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  28.12 
 
 
565 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  25.35 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46490  predicted protein  32.56 
 
 
268 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.971686  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  35.14 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.07 
 
 
478 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  28.12 
 
 
565 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0803  dual specificity protein phosphatase  36.62 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  26.04 
 
 
563 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  36.49 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  26.04 
 
 
568 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  26.04 
 
 
563 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  26.04 
 
 
563 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  27.27 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3344  dual specificity protein phosphatase  26.72 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0405  dual specificity protein phosphatase  40.79 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163885  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  42.37 
 
 
346 aa  43.5  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  31.4 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  29.11 
 
 
560 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  22.58 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  26.23 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3127  dual specificity protein phosphatase  35 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368556  normal  0.033409 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  30.19 
 
 
244 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  27.33 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27373  predicted protein  31.82 
 
 
363 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  27.78 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14549  predicted protein  27.52 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0761  hypothetical protein  29.63 
 
 
175 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.230339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1243  dual specificity protein phosphatase  38.75 
 
 
143 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2191  phosphatase-like protein  31.58 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  26.67 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  28.47 
 
 
197 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0265  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.57 
 
 
539 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03270  conserved hypothetical protein  40.48 
 
 
692 aa  40.8  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.34 
 
 
164 aa  40  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>