More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4088 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1111    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  51.97 
 
 		 545 aa  571  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  49.35 
 
 		 550 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  49.54 
 
 		 560 aa  534  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  47.83 
 
 		 568 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  47.83 
 
 		 563 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  47.65 
 
 		 563 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  47.73 
 
 		 563 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  47.57 
 
 		 547 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  47.16 
 
 		 552 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  46.12 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  46.25 
 
 		 565 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  45.87 
 
 		 565 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  45.89 
 
 		 565 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  46.31 
 
 		 581 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  32.89 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  36.33 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  35.69 
 
 		 328 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  34.11 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  35.02 
 
 		 322 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  33.81 
 
 		 478 aa  97.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  34.13 
 
 		 428 aa  94  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  34.76 
 
 		 468 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  31.55 
 
 		 464 aa  91.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  32.6 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  27.9 
 
 		 303 aa  88.2  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  33.18 
 
 		 246 aa  87.4  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  32.16 
 
 		 430 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3002  PAP2 family phosphatase  31.08 
 
 		 439 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3080  putative dual specificity phosphatase  31.08 
 
 		 439 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  33.17 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1291  PAP2 family phosphatase  31.08 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  31.25 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  32.51 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  31.25 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  27.46 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  31.84 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  31.39 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  31.84 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  31.84 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  32.51 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  32.51 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  27.76 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2473  diacylglycerol kinase catalytic region  26.48 
 
 		 371 aa  83.2  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  normal  0.358521 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  32.85 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  25.74 
 
 		 325 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  34.64 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  26.47 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1642  lipid kinase  29.76 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0775  diacylglycerol kinase catalytic region  26.3 
 
 		 316 aa  76.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3185  diacylglycerol kinase catalytic region  27.36 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  0.0401466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0619  hypothetical protein  28.96 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  25.19 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  25.88 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.38 
 
 		 367 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0030  diacylglycerol kinase catalytic region  28.57 
 
 		 288 aa  72  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000301  methylglyoxal synthase  26.53 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.235944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3562  lipid kinase  28.62 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1982  diacylglycerol kinase, catalytic region  33.77 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65141  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0403  diacylglycerol kinase catalytic region  26.91 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.749946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0378  diacylglycerol kinase catalytic region  26.77 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.727774  normal  0.4677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  26.23 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  32.78 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  23.36 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00205255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  23.97 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  25.64 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  25.24 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  27.65 
 
 		 314 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01140  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  27.56 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  24.67 
 
 		 303 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0338  hypothetical protein  33.12 
 
 		 305 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  25.24 
 
 		 300 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1172  Dual specificity phosphatase catalytic subunit  32.47 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0267685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2741  diacylglycerol kinase catalytic region  24.68 
 
 		 300 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.775354 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3658  putative dual specificity phosphatase  28.64 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0248  diacylglycerol kinase catalytic region  24.1 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00504383  hitchhiker  0.00109168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3052  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.44 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.397807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  25.24 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2884  Dual specificity protein phosphatase  30.69 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.170107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3519  diacylglycerol kinase catalytic region  27.1 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4164  diacylglycerol kinase catalytic region  25.26 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00574485  hitchhiker  0.00000041756 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0418  diacylglycerol kinase catalytic region  27.62 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  30.05 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24970  lipid kinase  28.67 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  24.92 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2655  diacylglycerol kinase, catalytic region  24.34 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2125  lipid kinase  29.55 
 
 		 295 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382632  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  24.92 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2400  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.39 
 
 		 290 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15890  conserved protein of unknown function BmrU  24.48 
 
 		 308 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000178842  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2148  diacylglycerol kinase catalytic region  23.41 
 
 		 314 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  22.37 
 
 		 303 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  24.61 
 
 		 300 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  28.14 
 
 		 293 aa  66.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  26.61 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0577  hypothetical protein  24.05 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1666  lipid kinase  28.9 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  24.61 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2079  lipid kinase  26.49 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>