More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0255 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  100 
 
 
581 aa  1191    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  44.17 
 
 
568 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  43.99 
 
 
563 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  44.17 
 
 
563 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  44.17 
 
 
563 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  45.95 
 
 
540 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  43.88 
 
 
560 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  42.47 
 
 
565 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  42.04 
 
 
565 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  41.86 
 
 
565 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  42.94 
 
 
545 aa  432  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  43.3 
 
 
547 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  42.46 
 
 
550 aa  432  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  42.07 
 
 
533 aa  422  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  40.98 
 
 
552 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  37.29 
 
 
322 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  34.22 
 
 
323 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  35.33 
 
 
328 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  31.31 
 
 
435 aa  140  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  32.24 
 
 
349 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  31.03 
 
 
468 aa  93.6  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  29.61 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  27.06 
 
 
300 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01140  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  30.67 
 
 
392 aa  88.2  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3842  diacylglycerol kinase catalytic region  29.87 
 
 
306 aa  87  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  26.4 
 
 
300 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  26.4 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  26.13 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4068  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.67 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  26.4 
 
 
300 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  27.36 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  28.32 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  26.71 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  26.71 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0248  diacylglycerol kinase catalytic region  29.81 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00504383  hitchhiker  0.00109168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  31.53 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  31.53 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  30.54 
 
 
471 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  28.06 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  25.81 
 
 
301 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  25.81 
 
 
301 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  25.81 
 
 
301 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  28.06 
 
 
309 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  25.74 
 
 
300 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  25.74 
 
 
300 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  25.74 
 
 
300 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  27.92 
 
 
304 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  25.74 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  27.27 
 
 
308 aa  82  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  25.81 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  25.81 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  25.81 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  25.81 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  25.81 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  25.81 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0139  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.14 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  31.43 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31730  hypothetical protein  31.43 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00205255  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  31.34 
 
 
467 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  25.96 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  24.18 
 
 
297 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  31.53 
 
 
428 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  25.08 
 
 
301 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  31.71 
 
 
438 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  31.71 
 
 
430 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  30.04 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.106325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  30.04 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  30.04 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  32.16 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  30.04 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  28.41 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2664  diacylglycerol kinase catalytic region  30.45 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  30.73 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0775  diacylglycerol kinase catalytic region  27.85 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  29.44 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  30.04 
 
 
438 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3185  diacylglycerol kinase catalytic region  27.86 
 
 
379 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  0.0401466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  30 
 
 
464 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  29.95 
 
 
246 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  26.92 
 
 
312 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0284  diacylglycerol kinase catalytic region  27.34 
 
 
359 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.34604 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  30.04 
 
 
430 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  27.07 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  26.62 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0264  diacylglycerol kinase catalytic region  26.53 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3476  putative lipid kinase  23.87 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  25.38 
 
 
300 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2473  diacylglycerol kinase catalytic region  29.05 
 
 
371 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  normal  0.358521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3229  diacylglycerol kinase catalytic region  27.7 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  23.26 
 
 
325 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  29.28 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  23.45 
 
 
326 aa  72  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1734  diacylglycerol kinase catalytic region  24.54 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  30.2 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1172  Dual specificity phosphatase catalytic subunit  30.18 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0267685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0577  hypothetical protein  29.14 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0030  diacylglycerol kinase catalytic region  32.42 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  27.22 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  26.37 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  30 
 
 
296 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>