More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1486 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  100 
 
 		 302 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  54.24 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  54.24 
 
 		 309 aa  331  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  52.04 
 
 		 308 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  51.55 
 
 		 298 aa  295  9e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  49.47 
 
 		 299 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  47.4 
 
 		 291 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  54.55 
 
 		 313 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  55.09 
 
 		 317 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  51.93 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  51.19 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  45.99 
 
 		 291 aa  275  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  47.39 
 
 		 317 aa  268  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  46.49 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  46.32 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  45.96 
 
 		 310 aa  258  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  44.06 
 
 		 302 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  44.06 
 
 		 302 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  43.25 
 
 		 300 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  45.1 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  41.26 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  38.08 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1590  diacylglycerol kinase catalytic region  38.99 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0967  hypothetical protein  35.08 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273578  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2891  diacylglycerol kinase catalytic region  36.43 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  35.2 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3667  putative lipid kinase  38.28 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3510  putative lipid kinase  38.26 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2141  diacylglycerol kinase catalytic region  31.67 
 
 		 311 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  32.14 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3598  putative lipid kinase  38.41 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  32.9 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1835  diacylglycerol kinase catalytic region  31.54 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00166325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  33.47 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  33.47 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  33.47 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  29.14 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  33.47 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  33.47 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  33.47 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  33.47 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  33.47 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  33.47 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  33.47 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1610  diacylglycerol kinase catalytic region  28.84 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  30.67 
 
 		 301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  33.47 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  30.56 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  32.51 
 
 		 315 aa  125  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  32.51 
 
 		 315 aa  125  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  29.5 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  32.2 
 
 		 364 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  28.78 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  28.78 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  28.78 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  28.78 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  28.78 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2853  hypothetical protein  42.14 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  28.78 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  28.78 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  28.78 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  31.82 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  28.21 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6348  diacylglycerol kinase, catalytic region  33.05 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1398  diacylglycerol kinase catalytic region  33.62 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175601  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4839  diacylglycerol kinase catalytic region  33.33 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0439501  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2178  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.65 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3900  diacylglycerol kinase catalytic region  35.48 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377313  normal  0.188998 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_357  hypothetical protein  31.11 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000445799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  31.69 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1090  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.57 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0414  hypothetical protein  32.37 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0557912  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  28.08 
 
 		 435 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1766  hypothetical protein  30.52 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0393  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.54 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0393706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3762  diacylglycerol kinase  34.01 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  25 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  31.08 
 
 		 349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2771  diacylglycerol kinase  32.65 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148668  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2392  diacylglycerol kinase catalytic region  32.44 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2148  diacylglycerol kinase catalytic region  30.46 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  29.71 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  31.16 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1821  diacylglycerol kinase catalytic region  34.75 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2655  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.95 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3057  hypothetical protein  35.06 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  31.47 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0173  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.28 
 
 		 506 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.373591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3300  lipid kinase  33.76 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  31.2 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  25.61 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12281  diacylglycerol kinase  31.05 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.538329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.3 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2079  lipid kinase  31.2 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  28.41 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3527  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  27.8 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  29.47 
 
 		 303 aa  106  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1516  diacylglycerol kinase catalytic region  31.28 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.251162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3156  diacylglycerol kinase catalytic region  28.33 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>