83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1730 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
246 aa  501  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  46.75 
 
 
478 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  33.77 
 
 
438 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  33.33 
 
 
430 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  32.89 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  32.46 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  32.89 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  32.89 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  33.33 
 
 
430 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  33.33 
 
 
438 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  32.46 
 
 
430 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  39.27 
 
 
449 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  30.84 
 
 
545 aa  98.2  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1291  PAP2 family phosphatase  34.78 
 
 
439 aa  96.3  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3002  PAP2 family phosphatase  34.78 
 
 
439 aa  95.9  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3080  putative dual specificity phosphatase  34.78 
 
 
439 aa  95.9  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  32.88 
 
 
428 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0008  dual specificity protein phosphatase  36.32 
 
 
445 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.851139  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3658  putative dual specificity phosphatase  39.15 
 
 
444 aa  92.8  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5538  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  34.27 
 
 
451 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4660  Dual specificity protein phosphatase  32.73 
 
 
449 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  32.29 
 
 
540 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2884  Dual specificity protein phosphatase  33.66 
 
 
437 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.170107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31730  hypothetical protein  37.95 
 
 
437 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00205255  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  31.86 
 
 
464 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  26.64 
 
 
568 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  27.43 
 
 
563 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  27.43 
 
 
563 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1172  Dual specificity phosphatase catalytic subunit  27.95 
 
 
428 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0267685  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  32.26 
 
 
581 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  27 
 
 
563 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2877  putative phosphatase protein  33.66 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510949  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  27.92 
 
 
565 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  26.89 
 
 
533 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  34.83 
 
 
471 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  34.83 
 
 
471 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  27.16 
 
 
565 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  27.5 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  34.39 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
471 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  25.11 
 
 
550 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  27.32 
 
 
560 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  26.56 
 
 
552 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1068  dual specificity protein phosphatase  28.19 
 
 
180 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43165  predicted protein  33.33 
 
 
269 aa  62.4  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  25.52 
 
 
547 aa  62.4  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35464  predicted protein  30.66 
 
 
196 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  35.29 
 
 
467 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  35.11 
 
 
189 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  30.22 
 
 
178 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  34.85 
 
 
189 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  34.35 
 
 
189 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  28.99 
 
 
181 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  32.62 
 
 
167 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  26.79 
 
 
419 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  34.29 
 
 
467 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  27.78 
 
 
152 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2133  dual specificity protein phosphatase  30.94 
 
 
186 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215956  normal  0.306582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  28.46 
 
 
500 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0309  hypothetical protein  24.64 
 
 
141 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0154  hypothetical protein  24.64 
 
 
141 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  30.99 
 
 
161 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  28.7 
 
 
169 aa  49.3  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  25.77 
 
 
165 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  31.09 
 
 
369 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  27.33 
 
 
161 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_006686  CND03270  conserved hypothetical protein  31.06 
 
 
692 aa  46.6  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  32.11 
 
 
156 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  32.11 
 
 
156 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  32.11 
 
 
156 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  34.41 
 
 
478 aa  45.4  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  31.86 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04419  dual specificity phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07080)  28.37 
 
 
351 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  31.19 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28 
 
 
490 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  24.69 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  28.74 
 
 
346 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02800  protein tyrosine/threonine phosphatase, putative  32.98 
 
 
1114 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_52425  predicted protein  41.27 
 
 
298 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  30.09 
 
 
156 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  28.32 
 
 
156 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  28.32 
 
 
156 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  25 
 
 
562 aa  42  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>