74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1987 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
346 aa  709    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  48.99 
 
 
419 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  47.59 
 
 
370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  50.22 
 
 
500 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  41.16 
 
 
369 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  31.39 
 
 
233 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  31.82 
 
 
563 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  31.82 
 
 
568 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  31.82 
 
 
563 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  31.82 
 
 
563 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  35.51 
 
 
189 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  38.37 
 
 
560 aa  61.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  36.36 
 
 
550 aa  60.5  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  34.09 
 
 
552 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  30.5 
 
 
227 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  34.58 
 
 
189 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  28.78 
 
 
162 aa  59.7  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  28.89 
 
 
507 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  32.77 
 
 
565 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  33.64 
 
 
189 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  32.77 
 
 
565 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  31.91 
 
 
545 aa  57  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  24.56 
 
 
169 aa  57  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  36.56 
 
 
565 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  29.07 
 
 
533 aa  56.2  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  27.86 
 
 
581 aa  56.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  32.61 
 
 
223 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  35.23 
 
 
547 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1068  dual specificity protein phosphatase  28.57 
 
 
180 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  34.04 
 
 
438 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  30.94 
 
 
222 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  34.19 
 
 
158 aa  54.3  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  31.62 
 
 
156 aa  53.9  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43165  predicted protein  26.36 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  30.49 
 
 
188 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  31.9 
 
 
156 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  30.43 
 
 
223 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0438  hypothetical protein  32.33 
 
 
203 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  33 
 
 
478 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  42.37 
 
 
147 aa  51.6  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  29.29 
 
 
222 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  41.79 
 
 
189 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  27.27 
 
 
152 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  30.39 
 
 
540 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  29.01 
 
 
207 aa  50.4  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  31.62 
 
 
156 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  32.23 
 
 
194 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  32.48 
 
 
156 aa  49.3  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  32.71 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  38.46 
 
 
197 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  30.21 
 
 
168 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  28.74 
 
 
246 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  29.37 
 
 
239 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
181 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  31.67 
 
 
156 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  31.67 
 
 
156 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  31.67 
 
 
156 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  29.06 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  27.61 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  30.83 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2580  dual specificity protein phosphatase  38.98 
 
 
183 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254118  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  27.59 
 
 
276 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  25.34 
 
 
202 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  28.47 
 
 
167 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  29.03 
 
 
165 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  30.56 
 
 
156 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  27.66 
 
 
167 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  28.47 
 
 
156 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1539  Dual specificity protein phosphatase  40.85 
 
 
177 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0521424  normal  0.144232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  29.06 
 
 
156 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4369  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
162 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  30.61 
 
 
241 aa  43.1  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27373  predicted protein  25.4 
 
 
363 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  28.68 
 
 
161 aa  43.1  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>