60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1461 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
156 aa  323  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  77.56 
 
 
156 aa  254  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  76.92 
 
 
156 aa  254  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  76.28 
 
 
156 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  75 
 
 
156 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  75 
 
 
156 aa  249  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  75 
 
 
156 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 
156 aa  249  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  72.44 
 
 
156 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  72.44 
 
 
156 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  72.44 
 
 
156 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  71.79 
 
 
156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  71.15 
 
 
156 aa  231  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  62.18 
 
 
156 aa  208  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  61.29 
 
 
159 aa  202  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  54.19 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  27.14 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  26.36 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  32.48 
 
 
181 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  28.1 
 
 
533 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  30.6 
 
 
547 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  33.67 
 
 
244 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
178 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  28.37 
 
 
370 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  32.71 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  28.89 
 
 
565 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  28.89 
 
 
565 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  28.89 
 
 
565 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  28.81 
 
 
540 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  30.21 
 
 
550 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  28.81 
 
 
560 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0154  hypothetical protein  32.63 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  28.38 
 
 
438 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0309  hypothetical protein  32.63 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  30.97 
 
 
563 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  30.97 
 
 
563 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  33.93 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  27.05 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  30.97 
 
 
568 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  32.18 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  29.82 
 
 
563 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  31.62 
 
 
346 aa  44.3  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  25.49 
 
 
202 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  26.72 
 
 
507 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  25.36 
 
 
169 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  38.89 
 
 
243 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  29.66 
 
 
478 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  44.44 
 
 
250 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  25 
 
 
419 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  32.67 
 
 
189 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  30 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  30.28 
 
 
189 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  26.02 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
243 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  26.36 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  34.33 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  26.04 
 
 
232 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  30.28 
 
 
189 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  29.35 
 
 
188 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  29.75 
 
 
166 aa  40.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>