32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3774 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  66.2 
 
 		 222 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  61.36 
 
 		 222 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  55 
 
 		 223 aa  263  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  48.88 
 
 		 227 aa  246  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  51.4 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  45.41 
 
 		 233 aa  201  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  35 
 
 		 197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  35.29 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  39.66 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  29.91 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  29.11 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  33.8 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  33.78 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  32.19 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  31.69 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  31.88 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  29.71 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  30.43 
 
 		 175 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  28.37 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  29.58 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  22.95 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  27.66 
 
 		 419 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  30.23 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  25.68 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  29.01 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  27.19 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  26.88 
 
 		 133 aa  42.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  31.62 
 
 		 169 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>