37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0883 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  275  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  40.59 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  40.51 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  42.7 
 
 
194 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  35.45 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  33.33 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  34.31 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  34.75 
 
 
167 aa  54.3  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  32.79 
 
 
163 aa  53.9  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  37.39 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  34.11 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  29.82 
 
 
175 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  35.19 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  29.1 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  35.71 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  29.73 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  34.69 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  34.02 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  35.14 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  34.69 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  37.14 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  36.46 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3008  hypothetical protein  30 
 
 
223 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00932756  hitchhiker  0.0017444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  27.47 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  31.52 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  33.96 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  37.63 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  26.88 
 
 
223 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  27.78 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  30 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0824  hypothetical protein  32.56 
 
 
142 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  32.26 
 
 
225 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4657  hypothetical protein  27.87 
 
 
249 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  29.82 
 
 
218 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  28.97 
 
 
271 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>