66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0830 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 166 aa  345  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  41.98 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  41.27 
 
 		 155 aa  104  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  31.82 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  37.7 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  37.14 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  37.25 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  31.69 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  34.31 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  31.9 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  37.08 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  33.33 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  35.96 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  35.96 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  31.43 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  29.13 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  32.22 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0638  hypothetical protein  39.33 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.821498  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  34.83 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  25.71 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  33.96 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  30.21 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  25.71 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  31.78 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  32.18 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  30.93 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  32.18 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0008  hypothetical protein  33.93 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4149  hypothetical protein  36.27 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0006  protein of unknown function UPF0153  36.27 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  30.89 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1893  protein of unknown function UPF0153  38.04 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  30.89 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  31.93 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  37.65 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2168  hypothetical protein  46.43 
 
 		 268 aa  50.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0014  hypothetical protein  30.39 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  25.34 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  32.67 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3109  hypothetical protein  31.43 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  35.63 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  34.41 
 
 		 112 aa  47.4  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0357  hypothetical protein  31.19 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  29.84 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  36.84 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3618  hypothetical protein  32.11 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0351  hypothetical protein  31.19 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  32.32 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3669  hypothetical protein  31.19 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  33.96 
 
 		 133 aa  45.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  25.93 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  32.99 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  29.03 
 
 		 138 aa  44.7  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4354  Fe-S-cluster oxidoreductase  30.85 
 
 		 108 aa  44.3  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0113  hypothetical protein  27.78 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  27.66 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0165  hypothetical protein  56.67 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2373  hypothetical protein  36.25 
 
 		 116 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.960402  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1667  hypothetical protein  38.82 
 
 		 185 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.131442 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  26.88 
 
 		 246 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63680  hypothetical protein  51.43 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  29.63 
 
 		 222 aa  41.6  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5536  hypothetical protein  51.43 
 
 		 130 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0504  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  41.2  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  27.08 
 
 		 167 aa  40.8  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  29.9 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>