17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1904 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  462  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  31.45 
 
 
156 aa  52.4  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  25 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  28.36 
 
 
156 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  25.34 
 
 
166 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  29.03 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  25.49 
 
 
148 aa  49.7  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  29.03 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  32.09 
 
 
180 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  27.42 
 
 
175 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  26.92 
 
 
149 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  28.7 
 
 
140 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  26.39 
 
 
444 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  25.69 
 
 
246 aa  45.1  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  25 
 
 
142 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  28.03 
 
 
155 aa  43.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  28.46 
 
 
152 aa  41.6  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>