30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0491 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  509  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  56.05 
 
 
229 aa  279  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2098  protein of unknown function UPF0153  55.95 
 
 
237 aa  269  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  56.76 
 
 
237 aa  260  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0644  hypothetical protein  51.05 
 
 
243 aa  248  5e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  52.76 
 
 
240 aa  218  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1546  hypothetical protein  51.9 
 
 
229 aa  192  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.231581  hitchhiker  0.0000778031 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  31.21 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  29.91 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  36.27 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  33.02 
 
 
186 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  34 
 
 
179 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  29.14 
 
 
218 aa  52.8  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2168  hypothetical protein  26.67 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2772  protein of unknown function UPF0153  32.41 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  27.14 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  21.83 
 
 
210 aa  45.4  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  45.4  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  30.77 
 
 
175 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  25.69 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  28.42 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  30.77 
 
 
156 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  31.54 
 
 
163 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  31.54 
 
 
163 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  25.13 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  34.34 
 
 
163 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  27.96 
 
 
221 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0129  hypothetical protein  30.61 
 
 
210 aa  42  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.392648  hitchhiker  0.00225213 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  26.88 
 
 
166 aa  42  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>