43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1006 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 156 aa  323  8.000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  58.87 
 
 		 152 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  55.71 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  49.04 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  52.11 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  50 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  36.94 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  31.9 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  32.08 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  36.36 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  35.29 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  31.45 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  29.52 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  27.45 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  34.94 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  29.09 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  29.69 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  32.48 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  32.48 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  29.35 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  26.79 
 
 		 271 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  27.47 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  30.77 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  27.88 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  26.19 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  28.89 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  25.18 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  30.77 
 
 		 246 aa  43.9  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  30.59 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  29.17 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  30.59 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  30.59 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  29.47 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  29.73 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  29.46 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1893  protein of unknown function UPF0153  26.19 
 
 		 117 aa  42.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  27.96 
 
 		 224 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  26.73 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  29.27 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  29.29 
 
 		 218 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  22.93 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  25 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>