28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0626 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  232  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  89.81 
 
 		 113 aa  208  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  86.36 
 
 		 113 aa  207  6e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  36.05 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  32.58 
 
 		 152 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  29.21 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  29.67 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  35.05 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  32.63 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  31.87 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  30.11 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  32.97 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  30 
 
 		 194 aa  46.2  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  30.93 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  32.29 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  30.34 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  28.89 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  32.97 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  30.43 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  31.18 
 
 		 222 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1260  hypothetical protein  26.6 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000027682  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0986  hypothetical protein  30.39 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  26.88 
 
 		 164 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  26.21 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  25.53 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  25.77 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>