40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0177 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  463  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  31.88 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  34.88 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  27.54 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  26.02 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  32.73 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  30.83 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  28.46 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  27.34 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  26.72 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  30.63 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  28.45 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  28.33 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  21.59 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  24.12 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  30.95 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0357  hypothetical protein  47.22 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  28.07 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  29.67 
 
 		 149 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  30.77 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  30.85 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1797  protein of unknown function UPF0153  27.62 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.370926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  45.1  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  28.72 
 
 		 151 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  27.84 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  25.23 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4922  protein of unknown function UPF0153  34.12 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  31.03 
 
 		 170 aa  42.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  23.36 
 
 		 152 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2581  hypothetical protein  44.74 
 
 		 328 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  28.41 
 
 		 164 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  25.23 
 
 		 180 aa  42.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  27.96 
 
 		 156 aa  42  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  29.21 
 
 		 245 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  24.73 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  28.26 
 
 		 281 aa  41.6  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  32.22 
 
 		 167 aa  41.6  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>