29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1831 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 
257 aa  532  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  70.43 
 
 
257 aa  403  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  69.02 
 
 
260 aa  374  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  46.67 
 
 
265 aa  245  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  39 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  40.43 
 
 
303 aa  194  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  41.35 
 
 
256 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  36.13 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  34.03 
 
 
273 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  37.45 
 
 
250 aa  168  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  34.62 
 
 
260 aa  163  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  35.02 
 
 
242 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  38.2 
 
 
242 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  31.82 
 
 
258 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  32.77 
 
 
261 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  37.55 
 
 
244 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  28.21 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  32.35 
 
 
276 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  27.98 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  28.99 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  32.58 
 
 
221 aa  72  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  28.3 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  31.88 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  31.3 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  31.33 
 
 
151 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  30.12 
 
 
175 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  28.24 
 
 
172 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  37.18 
 
 
170 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  26.96 
 
 
271 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>