26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2621 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  508  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  37.99 
 
 
263 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  36.78 
 
 
258 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  35.83 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  37.55 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  37.24 
 
 
273 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  37.61 
 
 
257 aa  158  9e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  36.55 
 
 
258 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  34.62 
 
 
260 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  34.45 
 
 
261 aa  142  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  33.63 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  36.4 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  34.48 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  31.28 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  36.68 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  28.09 
 
 
242 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  29.66 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  32.1 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  31.07 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  30.64 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  31.21 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  25.77 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  24.12 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  31.76 
 
 
170 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0357  hypothetical protein  26.81 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  27.83 
 
 
142 aa  42  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>