27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1650 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  50.21 
 
 		 242 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  42.98 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  35.54 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  38.5 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  38.2 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  39.56 
 
 		 240 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  34.07 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  36.56 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  33.91 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  35.96 
 
 		 265 aa  144  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  34.35 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  34.84 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  34.06 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  31.88 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  39.15 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  31.9 
 
 		 276 aa  85.5  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  33.54 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  26.21 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  26.81 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  33 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  34.07 
 
 		 170 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  25.86 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  22.14 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  28.7 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>