27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2665 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  550  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  44.71 
 
 
257 aa  247  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  46.67 
 
 
257 aa  245  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  43.14 
 
 
260 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  41.53 
 
 
263 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  41.46 
 
 
256 aa  191  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  39.53 
 
 
303 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  37.5 
 
 
242 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  37.97 
 
 
250 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  36.36 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  34.31 
 
 
260 aa  162  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  32.1 
 
 
273 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  35.83 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  31.06 
 
 
261 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  31.87 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  35.96 
 
 
242 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  35.62 
 
 
240 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  32.72 
 
 
276 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  32.39 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  28.93 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  30 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  38.54 
 
 
222 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  27.54 
 
 
224 aa  55.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  30.53 
 
 
170 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1961  hypothetical protein  30.93 
 
 
228 aa  45.8  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  25.18 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0644  hypothetical protein  30.21 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>