24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2337 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 273 aa  567  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  77.2 
 
 		 258 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  57.81 
 
 		 261 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  50.58 
 
 		 258 aa  271  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  37.45 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  34.03 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  34.48 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  32.1 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  37.24 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  32.33 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  34.82 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  34.07 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  38.53 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  31.6 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  35 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  34.73 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  31.74 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  31.61 
 
 		 276 aa  88.6  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  27.62 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  30.38 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  29.03 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  28.46 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  32.5 
 
 		 170 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>