26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0460 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  532  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  45 
 
 
242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  44.16 
 
 
250 aa  211  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  42.98 
 
 
242 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  41.46 
 
 
265 aa  191  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  40.87 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  41.35 
 
 
257 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  38.04 
 
 
260 aa  175  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  36.93 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  32.77 
 
 
263 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  37.5 
 
 
240 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  34.58 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  33.62 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  35.04 
 
 
303 aa  139  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  31.56 
 
 
258 aa  138  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  34.73 
 
 
273 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  33.63 
 
 
244 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  31.29 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  33.56 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  29.68 
 
 
273 aa  62  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  27.61 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  25.6 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  21.59 
 
 
224 aa  48.9  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  26.11 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  32.17 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  28.75 
 
 
170 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>