31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1054 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  549  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  41.53 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  39 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  41.39 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  37.76 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  37.71 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  35.86 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  37.85 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  37.45 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  37.45 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  37.99 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  34.36 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  32.77 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  32.63 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  29.82 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  34.3 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  34.84 
 
 		 242 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  30.43 
 
 		 276 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  28.24 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  26.38 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  35.64 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  28.74 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  30.83 
 
 		 224 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  33.33 
 
 		 170 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  26.09 
 
 		 175 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  20.74 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  27.41 
 
 		 151 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  25 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  28.89 
 
 		 171 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  34.07 
 
 		 112 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  24.78 
 
 		 142 aa  42.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>