29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0358 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 
258 aa  534  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  50.58 
 
 
273 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  51.98 
 
 
258 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  45.45 
 
 
261 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  37.45 
 
 
263 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  37.04 
 
 
244 aa  159  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  31.82 
 
 
257 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  32.38 
 
 
257 aa  152  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  31.87 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  30.95 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  34.35 
 
 
242 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  30.04 
 
 
242 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  32.53 
 
 
260 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  31.56 
 
 
256 aa  138  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  33.76 
 
 
303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  31.25 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  32.7 
 
 
240 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  30.43 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  29.41 
 
 
276 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  27.17 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  27.27 
 
 
221 aa  62  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  33.33 
 
 
170 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  27.86 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  34.88 
 
 
224 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  32.43 
 
 
175 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  32.65 
 
 
151 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  31.43 
 
 
138 aa  46.2  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  34.26 
 
 
167 aa  45.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  28.89 
 
 
171 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>