59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2019 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 222 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  58.06 
 
 		 221 aa  259  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  33.57 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  29.81 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  34.53 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  28.3 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  27.01 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  29.14 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  31.21 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  35.64 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  29.48 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  34.45 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  26.45 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  38.54 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  27.61 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  35.42 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  27.27 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  27.61 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  36.47 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  27.86 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  31.67 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  30.43 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  34.02 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  26.02 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  29.03 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  35.29 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  36.36 
 
 		 168 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  38.37 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  33 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  35.29 
 
 		 156 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  31.73 
 
 		 142 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  28.48 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  27.93 
 
 		 140 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  48.9  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  34.12 
 
 		 152 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  35.37 
 
 		 153 aa  48.5  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  31.18 
 
 		 156 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  32.18 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1961  hypothetical protein  23.96 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  29.46 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  32.93 
 
 		 112 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  23.93 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  31.31 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  33.73 
 
 		 261 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1893  protein of unknown function UPF0153  30.12 
 
 		 117 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  32.98 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  28.42 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  27.97 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  27.96 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  28.57 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  27.72 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  31.18 
 
 		 110 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1173  hypothetical protein  28.24 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0137  hypothetical protein  27.47 
 
 		 209 aa  42  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.314287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  29.27 
 
 		 140 aa  42  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  29.7 
 
 		 444 aa  42  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  29.63 
 
 		 166 aa  41.6  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  32.47 
 
 		 138 aa  41.6  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>