36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1951 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 164 aa  342  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  45.39 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  45 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  48.68 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  43.42 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  43.59 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  35.1 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  25.62 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  40.51 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  25.95 
 
 		 281 aa  50.8  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  32.61 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  27.27 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  26.98 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  31.18 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  25.23 
 
 		 273 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  31.11 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  22.61 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  26.42 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  33.72 
 
 		 303 aa  44.3  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  33.33 
 
 		 276 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  22.32 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  28.57 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  29.59 
 
 		 271 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  26.88 
 
 		 110 aa  42  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  32.1 
 
 		 163 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  30.95 
 
 		 245 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  29.55 
 
 		 235 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  27.88 
 
 		 258 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  36.25 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  34.07 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  34.57 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1266  protein of unknown function UPF0153  28.69 
 
 		 246 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  24.58 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  32.1 
 
 		 163 aa  40.4  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  32.1 
 
 		 163 aa  40.4  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>